הרעיון להקמת יד להנצחת מורשתו של יצחק טבנקין ולחקר הקיבוץ וההתיישבות, כלל כבר מראשיתו את המדור להוצאה לאור, כחלק בלתי נפרד ממנו. לא כל מכון מחקר מתהדר באגף כזה, שמטרתו הדפסה עצמית של ספרים, חוברות וכתבי עת ברמה הגבוהה ביותר. מקימי יד טבנקין ראו זאת. הם ידעו שמדור הוצאה לאור חיוני ביותר לשמירת עצמאותו של המכון, לביסוס מחקר הקיבוץ ולהפצתו לא רק בקרב הקהילייה הקיבוצית, אלא גם בקרב כלל תושבי ישראל.
לפעילות עצמאית זו גויסו במשך השנים מיטב בעלי המקצוע, עורכים, מתרגמים ומוציאים לאור מקרב חברי הקיבוצים והוקצו להם כל האמצעים הדרושים למילוי שליחותם. ההקפדה על רמת המחקר הגבוהה חייבה פרסומים ברמה גבוהה, ואלה אכן זוכים לאזכורים אין-ספור במחקרים של חוקרים חיצוניים בארץ ובעולם.
למדור מגיעים כתבי-היד שאושרו בוועדת המחקר של המרכז ועברו קריאה ואישור של קוראים (לקטורים) – כולם מומחים בתחומי המחקר.
לאחר מכן עוברים כתבי היד עריכה קפדנית ואת כל שלבי ההפקה עד היצירה המוגמרת – ספר חדש. יד טבנקין מפרסם את פירות המחקר של חוקריו וכן ספרים של חוקרים חיצוניים בנושאים הרלוונטיים לסדר יומו.
- רוזן, דורון, סולל בונה בשירות ביטחון היישוב היהודי בארץ ישראל בשנים 1936 – 1948, יד טבנקין 2017.
- יובל דרור (עורך), קיבוץ ויהדות , יד טבנקין ומוסד ביאליק, 2017.
- חלפין, תמה, 'היה רע לתפארת' – פוליטיקת הזיכרון של הלינה המשותפת, יד טבנקין ומכון בן-גוריון, 2016.
- עזתי, רוני, לפקודה תמיד אנחנו? , מכון בן גוריון לחקר ישראל והציונות, הקתדרה ללימודי תולדות קק"ל ומפעליה , יד טבנקין, ויד יערי, 2015. (פורסם במסגרת מיזם 'הקיבוץ במדינה').
- בורד, עופר, כסף השוד מידי ההורג, השילומים והפיצויים האישיים מגרמניה והתנועה הקיבוצית, מכון בן גוריון לחקר ישראל והציונות, הקתדרה ללימודי תולדות קק"ל ומפעליה , יד טבנקין, ,יד יערי , 2015.
- כץ יוסי וכץ רותי, בדרכן ילכו – מסע אל הנשים ההוטריות בקנדה, פרקי עיון ותיעוד, יד טבנקין 2015.
- עמית – כהן, עירית, חצר הקיבוץ – ערכים ונכסים, יד טבנקין 2014.
- עובד, יעקב, השכלה גבוהה בתנועה הקיבוצית – תולדות הקורס למדעי הרוח והחברה באפעל , בהשתתפות אהרון ידלין וברוך כנרי, יד טבנקין 2014.
- עזתי, רוני, לפקודה תמיד אנחנו? , מכון בן גוריון לחקר ישראל והציונות, הקתדרה ללימודי תולדות קק"ל ומפעליה , יד טבנקין, ויד יערי, 2015.
- ניר, הנרי, תנועה במילכוד – איחוד הקבוצות והקיבוצים בפוליטיקה, העשור הראשון, יד טבנקין, הקתדרה ללימודי תולדות קק"ל ומפעליה ויד יערי 2013.
- שמיר, יעקב, ביחד וביריבות – הקיבוץ המאוחד ומדינת ישראל 1948 – 1955 , בין "ריאליזם אוטופי" ל"ריאליזם ממלכתי", בהוצאת יד טבנקין, הקתדרה ללימודי תולדות קק"ל ומפעליה ויד יערי 2013.
- סיני,סמדר, השומרות שלא שמרו, נשים ומגדר ב'השומר' ובקיבוצו כפר גלעדי 1939-1907, יד טבנקין והקיבוץ המאוחד, 2014.
- פוגל-ביזאוי, סילביה ושרעבי, רחל (עורכות) , בין הפרטי לציבורי – נשים בקיבוץ ובמושב, יד טבנקין והוצ' מאגנס, 2013.
- שמיר, יעקב, ביחד וביריבות – הקיבוץ המאוחד ומדינת ישראל 1948 – 1955 בין "ריאליזם אוטופי" ל"ריאליזם ממלכתי", יד טבנקין, יד יערי, הקתדרה לחקר הקק"ל, בר אילן 2013.
- בן רפאל אליעזר , הקיבוץ – סיכון ההישרדות , יד טבנקין והוצאת מאגנס, המכון לחקר הקיבוץ והרעיון השיתופי –אונ' חיפה ואורנים, המכללה לחינוך, 2012.
- פז ישעיהו, אביגיל, תנאים של שותפות – קבוצה, קומונה ארצית וקיבוץ 1910 – 1926, מכון בן גוריון לחקר ישראל והציונות, יד טבנקין 2012.
- כהן-פרידהיים, רחל, החלוצים שנותרו מאחור – קליטת עליה בקיבוצים 1948 – 1954 , יד טבנקין 2012.
- כנרי, ברוך, סנוורים – פרוטוקול הסמינריון של פילוג הקיבוץ המאוחד, יד טבנקין 2011.
- אוסם, גבי והרץ לזרוביץ, רחל, מעגלים של הדרה, סיפורן של אמהות החינוך הקיבוצי, יד טבנקין, 2011.
סדרות מחקר של יד טבנקין שיצאו בשיתוף חוקרים
ממוסדות אקדמיים שונים:
• דפי רקע ובירור – סדרה לעבודות עיון קצרות ולדוחות ביניים של מחקרים. סך-הכול יצאו לאור בסדרה זו כ – 50 חוברות.
• הקיבוץ במפנה המאה – בראשותו של פרופ' אליעזר בן רפאל, סדרת מחקר (16 חוברות) על השינויים ותהליכי השינוי בקיבוץ מזוויות שונות.
• שיח תנועות הנוער – סדרת חוברות בעקבות מפגשי שיח על תולדות תנועות הנוער החלוציות.
• עין בוחנת – סדרה בת 8 חוברות על מחקר עכשווי של הקיבוץ.
• זרמים במחשבה היהודית – בעריכת חיים זליגמן ויעקב גורן. סך-הכול יצאו עד כה בסדרה ארבעה ספרים.
• מגדר וקיבוץ – בעריכתה המדעית של פרופ' סילביה ביזאוי. סדרת מחקרים על נשים ושוויון מגדרי בקיבוץ, במושב ובהתיישבות.
כתבי עת, שנתונים ותקופונים שיצאו:
• ילקוט למחשבה סוציאליסטית – רבעון המביא לקט מעיתונות העולם, בעריכת דן כרמון ז"ל. סך-הכול יצאו עשרות חוברות.
• שורשים – קבצים לחקר הקיבוץ ותנועת העבודה – שנתון המפרסם מחקרים ותעודות בנושאי ההתיישבות, הקיבוץ ותנועת העבודה. בעריכת ברוך כנרי. סך הכול יצאו לאור עשרה קבצים.
• שורשים במזרח – קבצים לחקר התנועה הציונית והחלוצית בקהילות ספרד והאסלאם וישראל בעריכת יצחק גרשון. סך הכול יצאו חמישה קבצים.
• מחברות מחקר – חוברות מחקר בתחומים שונים. סך הכול יצאו לאור עשרות חוברות.
• מחברות עיון – פרוטוקולים של ימי עיון ודיון.
• מפנה – במה לחברה הישראלית, רבעון בעריכת אלי אברהמי ואלי צור (בשיתוף יד יערי).
• מידע ומספרים – שנתון סטטיסטי לתנועה בקיבוצית. סך הכול יצאו לאור 15 שנתונים בין השנים 1993 – 2008
כבר מתחילת דרכו פנה יד טבנקין לקהלי יעד מגוונים ולא רק לחברי קיבוץ ולתושבי הארץ. בשיתוף המדור הבינלאומי של המכון יצאו לאור במשך השנים פרסומים שונים, שהופנו לדוברי שפות זרות:
באנגלית:
Call – Newsletter of the Intentional Communes Desk
Kibbutz Trends Facts & Figures
בגרמנית:
Kibbutz – Ein Ueberblick
Kibbutz Studien
בצרפתית:
Perspectives
בספרדית:
Kibbutz – Estudios y Enseyos
- פרסומים שונים אחרים שתורגמו מעברית לאיטלקית ולרוסית.